比DNA存储更可怕！你的照片居然可以存储在氨基酸分子溶液里
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实验原料和方法 化学库的制备 将36种不同代谢化合物的试剂级样品（S1文件中的表A）在二甲基亚砜（DMSO，无水）中稀释，标称浓度均为25mM。将一些代谢物首先溶解在替代溶剂（去离子水，可选择加入0.5M或1M的盐酸）中，以促进化合物在DMSO中的溶解。将10μL每种化合物等分到384孔的微量培养板（Labcyte384LDV）上。 数据混合物的准备 在规格为76mm×120mm不锈钢MALDI板上制备化学数据混合物。使用声学液体处理器（LabcyteEcho 550型）将化合物从培养板转移到MALDI板上。仪器标称的单液滴体积为2.5nL，但为了降低液滴体积变化对结果的影响，通常每种化合物使用2滴（5nL）。液滴以标准的2.25mm点距排布，共计1536个位置（32×48）。 将化合物按编好的位置滴到MALDI板上之后，需要将MALDI基质材料添加到每个位置上。我们选择9-氨基吖啶作为基质材料，因为它与代谢物库能够共存，它在小分子体系中具备低背景（low background）特征，同时支持正离子和负离子模式。将MALDI板放置在干燥环境中，大约在一夜时间即可完成结晶（最多10小时）。干燥后，可将板储存在湿度控制柜中，或进行MALDI-FT-ICR质谱分析。 数据板的质谱分析 实验中使用傅里叶变换离子回旋共振（FT-ICR）质谱仪（SolariX 7T，Bruker）分析结晶代谢物数据混合物。精确的成分结果是每个频谱上的测量时间的函数。这些实验中通常耗时0.5-1秒，产生的分辨精度<0.001Da。该仪器将连续测量48x32网格上的每种混合物的质谱。测定全部样本只需要不到2个小时。 为了从质谱中读取编码数据，将代谢物存在的概率建模为多个预测质量的组合。利用多项逻辑回归方法，考虑偏移量的自然指数，加上所有识别质谱信噪比之和，每个信噪比均与训练的权重系数相乘。在给定每种代谢物的n个最佳峰值输入的情况下，使用有限记忆BFGS算法来预测逻辑精度评分。 在实验中，对所有代谢组合成分重复以上过程。 （编辑：晋中站长网） 【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容! |
